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沼氣細菌分解有機物，產生沼氣的過程，叫沼氣發酵。沼氣發酵微生物是一個統稱，包括發酵性細菌、產氫產乙酸菌、耗氫產乙酸菌、食氫產甲烷菌、食乙酸產甲烷菌五大類群。五大類群細菌構成一條食物鏈。前三類群細菌的活動可使有機物形成各種有機酸，因此，將其統稱為不產甲烷菌；后二類群細菌的活動可使各種有機酸轉化成甲烷，因此，將其統稱為產甲烷菌。
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