內蒙古體系認證費用因認證類型、企業規模等因素而有所不同。以常見的 ISO9001 質量管理體系認證為例： 員工人數在 65 人以下，初審最低限價為 12000 元。  員工人數在 66-125 人，初審最低限價為 18000 元。 員工人數在 126-275 人，初審最低限價為 21000 元。 員工人數在 276-1000 人，初審最低限價為 33000 元。 員工人數在 1001-4000 人，初審最低限價為 45000 元。 員工人數在 4001 人以上時，每增加一個審核人日，認證收費最少增加 2400 元。
此外，監督審核的最低限價為相應初審最低限價的 1/3，復評的最低限價為相應初審最低限價的 2/3。 如果是 ISO14001 環境管理體系認證，若企業參保人數在 30 人左右，認證費用一般在 3500-5000 元，規模較大或行業環境風險等級較高時，費用可能在 6000-12000 元甚至更高。若企業需咨詢公司輔導，還需支付 500-1500 元左右的咨詢費，另外還需承擔審核員的差旅費，單個體系一般為 1000-1500 元。 三體系認證費用總體相對更高，小型企業一般在 3-5 萬元左右，中型企業在 5-10 萬元，大型企業可能超過 10 萬元。
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