內蒙古三體系認證的收費標準沒有固定值，受企業規模、認證機構、體系組合等因素影響，具體如下：
企業規模：企業員工人數越多，認證費用越高。以 ISO9001 質量管理體系認證為例，員工人數在 65 人以下，初審限價為 12000 元;66-125 人，初審限價為 18000 元;126-275 人，初審限價為 21000 元;276-1000 人，初審限價為 33000 元;1001 人及以上，初審限價為 45000 元，且每增加一個審核人日，認證收費最少增加 2400 元。認證機構：國際知名認證機構如 SGS、TÜV 等，收費較高，三體系初審起步價達 3 萬元甚至更高;國內的一般認證機構收費相對較低，三體系初審費用一般在 1.4 萬至 2 萬元左右。
體系組合：如果企業進行三體系結合審核，初審限價為相應的三個單體系初審限價之和的 65%，比單獨進行三個體系認證的費用總和要低。
其他費用：包括審核員的差旅費，這部分費用由企業實報實銷，單個體系的差旅費一般為 1000-1500 元。如果企業需要咨詢公司輔導，還需支付咨詢費，單體系咨詢費約 2000-5000 元。
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